Червени водорасли (пурпурни)
Повечето от тях са морски листни, храстовидни или корави макрофити, живеещи под линията на отлива. Цветът им е предимно червен поради наличието на пигмента фикоеритрин, но може да бъде лилав или синкав. Някои лилави се срещат в прясна вода, главно в потоци и бистри бързи реки. Batrachospermum е желатиново, силно разклонено водорасло, съставено от кафеникави или червеникави, подобни на мъниста клетки. Lemanea е подобна на четка форма, която често расте в бързо течащи потоци и водопади, където нейните тали се прикрепят към скалите. Audouinella е нишковидно водорасло, което се среща в малки реки. Ирландският мъх (Chondrus cripus) е често срещан морски макрофит. Лилавите не образуват подвижни клетки. Техният сексуален процес е много сложен и един жизнен цикъл включва няколко фази.
Почти всички са обитатели на морето. Само няколко вида са микроскопични, а сред макрофитите са най-големите водорасли в света. Последната група включва водорасли, фукуси, саргасум и лесония ("морски палми"), най-разпространени по бреговете на студените морета. Всички кафяви водорасли са многоклетъчни. Цветът им варира от зеленикавожълт до тъмнокафяв и се дължи на пигмента фукоксантин. Сексуалното размножаване е свързано с образуването на подвижни гамети с два странични флагела. Екземплярите, които образуват гамети, често са напълно различни от организми от същия вид, които се възпроизвеждат само чрез спори.
Диатомеи (диатомеи)
Те са обединени в клас Bacillariophyceae, който в използваната тук класификация е включен заедно със златните и жълто-зелените водорасли в отдела (типа) Chrysophyta на царството на протистите. Диатомеите са много голяма група едноклетъчниморски и сладководни видове. Цветът им е жълт до кафяв поради наличието на пигмента фукоксантин. Протопластът на диатомеите е защитен от силициева (стъклена) обвивка с форма на кутия - обвивка, състояща се от две клапи. Твърдата повърхност на клапите често е покрита със сложен модел от стрии, туберкули, ями и ръбове, характерни за вида. Тези черупки са едни от най-красивите микроскопични обекти и яснотата на разграничаване на техните модели понякога се използва за тестване на разделителната способност на микроскопа. Обикновено клапите са пробити с пори или имат празнина, наречена шев. Клетката съдържа ядрото. Освен клетъчното делене на две е известно и половото размножаване. Много диатомеи са свободно плуващи форми, но някои са прикрепени към подводни предмети с лигави стъбла. Понякога клетките се комбинират в нишки, вериги или колонии. Има два вида диатомеи: перести с удължени двустранно симетрични клетки (те са най-разпространени в сладките води) и центрични, чиито клетки, гледани от клапата, изглеждат заоблени или многоъгълни (те са най-разпространени в моретата).
Както вече споменахме, черупките на тези водорасли остават след клетъчната смърт и се утаяват на дъното на водните тела. С течение на времето техните мощни натрупвания се уплътняват в пореста скала - диатомит.
Флагелати
Тези организми, във връзка с тяхната способност за "животно" хранене и редица други важни характеристики, сега често се наричат подцарството на протозоите. Всички флагели са едноклетъчни и подвижни. Клетките са зелени, червени или безцветни. Някои видове са способни на фотосинтеза, докато други (сапрофити) абсорбират разтворената органична материя или дори поглъщат нейните твърди частици. Сексуалното размножаване е известно само при някои видове. Често срещан обитател на езерото е Euglena, зелено водорасло с червени очи. Тя плува сс помощта на един флагел, той е способен както на фотосинтеза, така и на хранене с готова органична материя. Euglena sanguinea може да оцвети езерната вода в червено в края на лятото.
Динофлагелати
Тези едноклетъчни флагеларни организми също често се наричат протозои, но те също могат да бъдат разграничени като независим отдел (тип) Pyrrophyta от кралството на протистите. Те са предимно жълто-кафяви, но могат да бъдат и безцветни. Техните клетки обикновено са подвижни; клетъчната стена отсъства при някои видове и понякога е с много странна форма. Сексуалното размножаване е известно само при няколко вида. Морският род Gonyaulax е една от причините за "червените приливи": той е толкова изобилен близо до бреговете, че водата придобива необичаен цвят. Това водорасло отделя токсични вещества, понякога водещи до смъртта на риби и миди. Някои динофлагелати причиняват фосфоресценция на водата в тропическите морета.
Златни водорасли
Те са включени, заедно с други, в отдел (тип) Chrysophyta на царството на протистите. Цветът им е жълто-кафяв, а клетките са подвижни (флагелирани) или неподвижни. Размножаването е безполово с образуване на импрегнирани със силициев диоксид кисти.
Жълтозелени водорасли
Сега е обичайно те да се комбинират със златните в отдел (тип) Chrysophyta, но те могат да се считат и за независим отдел (тип) Xanthophyta от кралството на протистите. По форма те са подобни на зелените водорасли, но се различават по преобладаването на специфични жълти пигменти. Техните клетъчни стени понякога се състоят от две половини, влизащи една в друга, а при нишковидните видове тези клапи са H-образни в надлъжно сечение. Сексуалното размножаване е известно само в няколко форми.
Това са многоклетъчни водорасли, които съставляват отдел (тип) Charophyta на царството на протистите. Цветът им варира от сивкавозелен досиво. Клетъчните стени често са инкрустирани с калциев карбонат, така че мъртвите остатъци от овъглили участват в образуването на мергелни отлагания. Тези водорасли имат цилиндрична, подобна на стъбло главна ос, от която страничните израстъци се простират на завитъци, подобни на листата на растенията. Characeae растат вертикално в плитки води, достигайки височина 2,5-10 см. Полово размножаване. Малко вероятно е Characeae да са близки до някоя от групите, изброени по-горе, въпреки че някои ботаници смятат, че те произлизат от зелени водорасли.