Етап на синтез на вирусни компоненти
Скоро следекспозицията на вирусния геномима намаляване или изчезване на инфекциозността, тъй като вирионите като такива вече не съществуват и инфекциозността на нуклеиновата киселина е много по-малка от инфекциозността на пълните вириони. Това явление се нарича затъмнение (затъмнение), а фазата на вирусна инфекция от момента на адсорбция до появата на нови инфекциозни вириони в клетката се нарича фаза на затъмнение или латентен период. При висока множественост на клетъчната инфекция някои от вирионите запазват своите инфекциозни свойства през цялата фаза на затъмнение, което често затруднява определянето на нейната продължителност.
През този периодпротичат всички основни процеси на вирусна репродукция, водещи до образуването на вирусни компоненти и образуването на ново потомство на вириони. С появата на първите новосинтезирани вириони в клетката приключва периодът на затъмнение на вирусната репродукция.Процесите, протичащи във фазата на затъмнение, са схематично показани на фигурата, която показва основните етапи на репликацията на аденовирус като пример.
От представената схема може да се види, че следзакрепване, вирионътнавлиза в клетката и частично или напълно губи своята обвивка, разкривайки вирусния геном. Някои ранни вирусни гени се транскрибират, за да образуват иРНК, които след това могат да бъдат модифицирани по различни начини, включително снаждане. Ранните иРНК се превеждат в три основни продукта: протеини, които инхибират или спират синтеза на протеини и нуклеинови киселини; протеини, които регулират експресията на вирусния геном; ензими, необходими за репликацията на вирусни нуклеинови киселини. След репликацията на вирусната нуклеинова киселина се транскрибират късни вирусни гени, чиито транслационни продукти са главно структурни вирусни протеини,използвани при сглобяването на нови вириони. Някои от тях претърпяват посттранслационни промени, преди да бъдат включени в структурата на вириона. Във всяка заразена клетка се образуват стотици и хиляди вириони, които, освобождавайки се, заразяват други клетки.
За повечето ДНК вирусиДНК транскрипцията и репликацията се извършват в клетъчното ядро, като се използва клетъчна РНК полимераза II и други клетъчни ензими. Повечето РНК вируси се репликират в цитоплазмата, където няма ензими, които копират РНК върху РНК шаблон, така че вирусният геном трябва сам да функционира като иРНК, или вирусът трябва да носи своя собствена РНК полимераза, за да транскрибира РНК върху РНК генома.
Синтезът на вирусни протеинисе осъществява само в цитоплазмата на клетката. В заразените клетки вирусните нуклеинови киселини и виболгар-специфичните протеини се синтезират в много по-големи количества, отколкото са включени във вирионите. Прекомерният синтез на структурни компоненти по време на възпроизводството на вируси е вид плащане за паразитизъм на генетично ниво.
Потомството навирионитесе появява след определен период от началото на синтеза на съставните им компоненти. Продължителността на периода от момента на заразяване до появата на потомствени вириони е доста променлива и отразява дълбоките различия между различните вируси.
Латентният период на малките вируси, които нямат обвивка и съдържат едноверижна РНК, продължава приблизително 2 часа и е най-краткият сред всички известни животински вируси. ДНК-съдържащите вируси имат по-дълъг латентен период. Дълъг латентен период също беше отбелязан за реовирусите и вируса на саркома на Rous. При обикновените малки РНК-съдържащи вируси не само латентният период, но и целиятцикъл на възпроизвеждане на вируса. Вирусите, чийто геном функционира като иРНК, имат по-кратък цикъл на репликация от вирусите, при които функциите на иРНК се изпълняват не от вирионна РНК, а от неговата комплементарна отрицателна верига.
ДНК-съдържащите вирусимогат да продължат да се размножават дори 24 часа след заразяването. Причините, които определят продължителността на цикъла на възпроизвеждане на различните вируси, не са изяснени. Възможно е това да се дължи на по-сложна последователност от събития по време на възпроизвеждането на големи, сложни вируси.
Скъсяването на латентния период при висока множественост на инфекцията еоткрито в различни РНКи ДНК вируси и може да се дължи на ускоряването на образуването на ензими, участващи в синтеза на нуклеинови киселини. При висока множественост на инфекцията ролята на капсидните протеини за ускоряване на началото на цикъла на възпроизвеждане също не е изключена.
Броят на инфекциозните вирусни частици, образувани в една клетказависи от вида на вирусаи техният брой варира много широко. Интересното е, че делът на продуктите, специфични за vibolgar, възлиза на 0,1 до 5% от масата на животинските клетки.