Катедра по микробиология - ФГБНУ - ЦНИИТ
В катедрата по микробиология работят 2 доктори и 3 кандидати на науките, бактериолози, лекари по клинична лабораторна диагностика.

От 1986 г. работи във Федералната държавна бюджетна научна институция "ЦНИИТ". От 1998 г. - доктор на биологичните науки, от 2007 г. е професор, от 2008 г. - ръководител на катедрата по микробиология.
Л.Н. Черноусова е един от водещите специалисти на ЦНИИТ в областта на фундаменталните изследвания. Областта на научни интереси включва експериментални изследвания на туберкулозна инфекция, имунен отговор при различни форми на туберкулоза, аспекти на патогенезата на туберкулозата (микробиологични и молекулярно-генетични характеристики на развитието на експериментална туберкулоза, лекарствена резистентност на микобактерии, тествани както чрез микробиологични методи, така и чрез определяне на точкови мутации в генома, MBT генотипизиране с помощта на RFLP, сполиго типизиране, VNTR-типиране). Научните интереси са свързани и с изучаването на механизмите на развитие на лекарствена резистентност на M.tuberculosis, изследването на най-често срещаните щамове на Mycobacterium tuberculosis Beijing cluster в България и изследването на тяхната повишена трансмисивност.
Основните научни теми са насочени към молекулярно-епидемиологични изследвания във фтизиатрия, разработване на ускорени методи за откриване и определяне на лекарствената чувствителност на Mycobacterium tuberculosis и създаване на съвременен алгоритъм за микробиологична диагностика на туберкулоза и микобактериоза. Важна област на научната дейност е разработването на подходи за изследване на ефективността на химиотерапията и тестване на нови противотуберкулозни съединения, идентифициране на най-активните от тях срещу MDR и XDR щамове.
Под ръководството на L.N. Черноусова защити 11 кандидати и 2докторски дисертации.
Той е ръководител на Центъра за върхови постижения на Мрежата от наднационални референтни лаборатории на СЗО, член е на Тематичната работна група по лабораторна диагностика на туберкулозата към РГРГ по туберкулоза на МЗ на България и СЗО, член е на Експертната група по лабораторна диагностика на туберкулозата към Федералния инспекторат по медицинско образование на Руската федерация, член на Общобълг. Научно-практическо дружество на епидемиолозите, микробиолозите и паразитолозите. И.И. Мечников; член на Българската асоциация на фтизиатрите (РОФ) и Националната асоциация на фтизиатрите (НАФ). Член на Академичния съвет на ЦНИИТ и редакционната колегия на списанията "Бактериология" и "Бюлетин на ЦНИИТ".
Изнася лекции и провежда семинари за специализанти и ординатори на ФГБНУ "ЦНИИТ" и лабораторни лекари от територията на България и страните от ОНД.
Автор на повече от 100 публикации, включително 1 монография и 3 глави в монография, 1 ръководство, 5 федерални ръководства, 5 патента.
От 2015 г. Катедрата по микробиология е сертифицирана от Световната здравна организация като център за върхови постижения за мрежата на наднационалните референтни лаборатории на СЗО.

Основните дейности на Катедрата по микробиология:
Basic research is aimed at studying the biological properties of M.tuberculosis, their virulence, survival characteristics in eukaryotic cells, pathogen-host interactions depending on the cluster affiliation of M.tuberculosis, studying the mechanisms of development of drug resistance and the ways of spread and transmission of both M.tuberculosis of various genetic clusters and non-tuberculous mycobacteria.
Приложните изследвания са насочени към автоматизиране на процедурите за молекулярно-генетична и микробиологична диагностика на туберкулоза, тестване и внедряване на иновативни диагностични тестови системи, оценка на тяхното значение за практическата фтизиатрия, разработване на нови подходи за видовата идентификация на туберкулозни и нетуберкулозни микобактерии, тестване на противотуберкулозната активност на нови синтетични и природни съединения срещу лабораторни и клинични щамове на M.tuberculosis в експерименти in vitro и ex vivo.
Клиничните изследвания имат за цел да открият туберкулозни и нетуберкулозни микобактерии и да определят тяхната чувствителност към лекарства.
- Организационна и методическа работа е участие в надзора на регионалните специализирани бактериологични лаборатории с цел подобряване на качеството на микробиологичните изследвания и контрол на инфекциите в противотуберкулозните институции, разработването на нормативни документи, насоки и научни и методически препоръки, преподавателска и експертна дейност.
- Сътрудничество с международни организации.
- Действайки като Национален център за върхови постижения за Наднационалната мрежа за туберкулозаРеферентни лаборатории на СЗО.
Катедрата по микробиология включва 2 лаборатории:
Лаборатория по микробиологична диагностика на туберкулоза
Ръководител на лабораторията — Кандидат на биологичните науки, ст.н.с. Ларионова Елена Евгениевна

Лабораторията извършва следните изследвания:
- Бактериоскопия на диагностичен материал за наличие на киселинноустойчиви бактерии
- Инокулация на диагностичен материал върху плътна хранителна среда и течна хранителна среда в автоматичната система VASTEC MGIT
- Определяне на лекарствената чувствителност на Mycobacterium tuberculosis към 1-ва и 2-ра линия антилекарства в автоматичната система VASTEC MGIT
- Определяне на лекарствената чувствителност на MBT към пиразинамид PZA в автоматичната система VASTEC MGIT
- Определяне на лекарствената чувствителност на Mycobacterium tuberculosis към линезолид, PAS, моксифлоксацин върху течна хранителна среда в автоматичната система VASTEC MGIT
- Идентифициране и определяне на лекарствената чувствителност на нетуберкулозни микобактерии
Лаборатория по молекулярно-генетични методи на изследване
Ръководител на лабораторията — доктор на биологичните науки, професор Черноусова Лариса Николаевна

В лабораторията се извършват следните видове изследвания:
- Откриване на MBT ДНК чрез PCR в реално време от диагностичен материал
- Определяне на чувствителността на MBT към рифампицин (RIF), изониазид (INH) и флуорохинолони (FQ) чрез PCR в реално време от диагностичен материал
- Откриване на MBT ДНК и определяне на PM към рифампицин (RIF) в патрона GeneXpert MTB\RIF
- Определяне на чувствителността къмрифампицин (RIF), изониазид (INH) и флуорохинолони (FQ), аминогликозиди/циклични пептиди (AG/CP) и етамбутол (EMB) върху ДНК ленти от диагностичен материал
- Идентифициране на култури за род Mycobacterium чрез PCR
- Определяне на вида на туберкулозната и нетуберкулозната микобактерия върху ДНК ленти
Ръководители на Катедрата по микробиология:
Севастянова Елина Викторовна
Доктор на биологичните науки, водещ изследовател

Завършва с отличие Московския технологичен институт на хранително-вкусовата промишленост със специалност „Технология на микробиологичното и витаминно производство“. От 1994 г. работи в отдела по микробиология на ЦНИИ. Многократно е повишавала квалификацията си в курсове за обучение, организирани от СЗО, CDC, IFRC, Eagleson Institute, FILHA, IUATLD. Участва активно в множество проекти за борба с туберкулозата, осъществявани в България с подкрепата на международни организации. В момента - служител на Центъра за върхови постижения на Мрежата от наднационални референтни лаборатории по туберкулоза на СЗО, преподавател в курсове за обучение, базирани на Центъра за обучение на ЦНИИТ, куратор на регионални лаборатории за диагностика на туберкулоза, секретар на Тематична работна група „Лабораторна диагностика на туберкулоза“ към Работна група на високо ниво по туберкулоза в България към Министерство на здравеопазването на България и СЗО , член на Инициативата за европейска лаборатория по туберкулоза към Европейския офис на СЗО, член на експертната група на ФСВОК по микробиологична диагностика на туберкулозата, секретар на Секцията по микробиология и имунология на туберкулозата към Общобългарското научно-практическо дружество на епидемиолозите, микробиолозите и паразитолозите. И.И. Мечникова (Московски клон), член на Българската асоциация на фтизиатрите (РОФ).
Основни направления на работа: разработване на оптимални принципи за организация на работата на лабораторна мрежа за диагностика на туберкулозата; анализ на дейността на лабораториите и подобряване на системата за осигуряване на качеството на микробиологичните изследвания; инфекциозен контрол в противотуберкулозните заведения и осигуряване на биологична безопасност в специализирани бактериологични лаборатории; разработване на нормативни документи, указания и научно-методически препоръки; преподавателска и експертна дейност. Автор на повече от 100 публикации, включително 6 учебника, 4 федерални клинични ръководства, 5 ръководства, 1 ръководство за лекари и 1 ръководство за лекари.
Смирнова Татяна Генадиевна
Кандидат на медицинските науки, старши научен сътрудник

Завършила е БДМУ през 1998 г., Медико-биологически факултет, катедра Биохимия, специалност – молекулярна биология. Основни и сродни специалности: биохимик, микробиология, лекар по клинична лабораторна диагностика. От 1998 г. работи във Федералната държавна бюджетна научна институция "ЦНИИТ" в катедрата по микробиология, в лабораторията по молекулярно-генетични методи на изследване. Сътрудник на Центъра за високи постижения, Мрежа от наднационални референтни лаборатории на СЗО. Преподавател на курсове за обучение в ЦНИИТ по микробиологична и молекулярно-генетична диагностика на туберкулоза и микобактериални инфекции, специалист по обучение по автоматизираната система BACTEC MGIT 960, експерт по лабораторна диагностика на фтизиатричния профил, един от разработчиците на нормативни документи.
Област на научни и клинични интереси: специалист в областта на микробиологичната и молекулярната генетикадиагностика на туберкулоза и определяне на лекарствената чувствителност на микобактерии, генотипиране на щамове M.tuberculosis комплекс (сполиготипиране, RFLP IS6110), подобряване на диагностиката на инфекции, причинени от нетуберкулозни микобактерии, масспектрометричен анализ на протеинови профили на микобактерии от туберкулозния комплекс, нетуберкулозни микобактерии и неспецифични флора, разработване на методи за определяне на противотуберкулозната активност на новосинтезирани вещества in vitro и ex vivo. Автор на повече от 75 статии в чуждестранни и местни списания, включително 1 учебник, 4 насоки и 3 глави в ръководство за лекари. Автор на 2 патента. Има GCP сертификат.
Андреевская София Николаевна
Кандидат на медицинските науки, старши научен сътрудник

Основни и сродни специалности: биохимик, микробиология, лекар по клинична лабораторна диагностика. Завършила е Медико-биологическия факултет, катедра Биохимия на БДМУ през 1998 г., специалност молекулярна биология. От 1998 г. работи във Федералната държавна бюджетна научна институция "ЦНИИТ" в катедрата по микробиология, в лабораторията по молекулярно-генетични методи на изследване.Служител е на Центъра за върхови постижения на мрежата от наднационални референтни лаборатории на СЗО.