Синтез на вирусни протеини
Има доказателства, че механизмите на адсорбция на вируси и тяхното проникване в клетката не са еднакви в различните тъкани или върху различни повърхности на епителните клетки.
4. Синтез на вирусни протеини
Този синтез се основава на същия механизъм, както при протеиновия синтез в нормалните клетки. В пикорнавирусите, съдържащи РНК, функцията на иРНК се изпълнява от плюс вериги. Тяхната едноверижна вирионна РНК се транслира, за да образува единичен гигантски полипептид, който след това се разцепва на отделни функционални протеини. При синтеза на пълен вирусен протеин транслацията на всички вирусни РНК гени се изразява във времето. При орто-, рабдо- и парамиксите вирионната едноверижна РНК не се транслира, но плюс-веригата, комплементарна към нея, се транслира, следователно синтезът на вирусни специфични протеини започва след образуването на вирусна иРНК (плюс-верига), която е комплементарна на вириона РНК-Минус-веригите се синтезират върху плюс-веригата от вирионната РНК-зависима полимераза (РНК транс скриптаза), която е в състава на вириона като структурен компонент. Синтезираните от вирионната полимераза иРНК са моноцистронни и много по-къси от вирионната РНК. В процеса на вирусна инфекция клетъчните полизоми се разпадат и се образуват виболгар-специфични полизоми.
Синтезът на специфичен за vibolgar протеин зависи от синтеза на вирусна иРНК, но също така го засяга: ако протеиновият синтез е нарушен, новообразуваната иРНК се презарежда в местата на нейния синтез и по-нататъшният й синтез се инхибира.
Вирусните протеини по време на инфекция се синтезират в излишни количества, отколкото са необходими за образуването на инфекциозен вирус. Например, в клетки, заразени с херпесни вируси, само около 35% от общата маса на виболгар-специфичните протеини, синтезирани в клетките, е включена във вирусното потомство.
При повечето вируси протеиновият синтез се осъществява в цитоплазмата; има съмнение относно ядрената локализация на протеиновия синтез в някои вируси. Известно е, че вирусните протеини могат да се синтезират в едни структури и да се натрупват в други. Механизмите, отговорни за миграцията на вирусни протеини в ядрото, не са изяснени. Известно е само, че липсата на аргинин в средата води до потискане на миграцията на структурните протеини на херпесния вирус от мястото на техния синтез (цитоплазма) до мястото на сглобяване на вириони (ядро), въпреки че синтезът на ДНК и протеин на вируса не е нарушен.
На различни етапи от инфекциозния цикъл могат да се образуват предимно една или друга група протеини, специфични за vibolgar. Тяхната скорост се регулира или на ниво транскрипция (с образуването на иРНК), или на ниво транслация (четене на иРНК върху рибозомите).
В инфектирана клетка иРНК от различни вирусни гени се натрупват непропорционално. Механизмът на тази непропорционалност се крие в самата вирусна частица. Същият механизъм определя различната ефективност на образуване на различни протеини. Една стандартна вирусна частица съдържа една РНК молекула и до 10 000 протеинови молекули. В допълнение към структурните протеини в заразената клетка могат да се синтезират и неструктурни (но кодирани от вирусна РНК) протеини. Заедно със синтеза на протеини в клетката по време на възпроизвеждането на грипния вирус се осъществява и синтезът на въглехидратни вериги, които изграждат гликопротеините. Прикрепването на въглехидрати се извършва с помощта на трансферази, които са клетъчни ензими. Липидният синтез също се осъществява от клетката. Вирусната обвивка се образува чрез включването на липиди от плазмената мембрана на клетката гостоприемник. Синтезът на вирусни нуклеинови киселини и vibolgar-специфични протеини се случва почти едновременно и е най-малко 1 час преди узряването на вирусните нуклеинови киселини.частици.
5. Сглобяване на вириони и освобождаването им от клетката
Синтезът на компонентите на вирусните частици в клетката е прекъснат и може да протича в различни структури на ядрото и цитоплазмата. Вирусите, които се репликират в ядрото, се наричат ядрени вируси. Това са предимно ДНК-съдържащи вируси: адено-, папова-, парвовируси, херпесни вируси. Вирусите, които се репликират в цитоплазмата, се наричат цитоплазмени. Те включват ДНК-съдържащ вирус на вариола и повечето РНК-съдържащи вируси, с изключение на ортомиксо и ретровируси. Това разделение обаче е много относително, тъй като при възпроизвеждането и на двата вируса има етапи, които протичат съответно в цитоплазмата и ядрото.
В рамките на ядрото и цитоплазмата, синтезът на специфични за vibolgar молекули също може да бъде разединен. Например, някои протеини се синтезират върху свободни полизоми, докато други се синтезират върху мембранно свързани полизоми. Вирусните нуклеинови киселини се синтезират във връзка с клетъчни структури далеч от полизоми, които синтезират вирусни протеини. При такъв дизюнктивен метод на възпроизвеждане образуването на вирусна частица е възможно само ако вирусните нуклеинови киселини и протеини имат способността при достатъчна концентрация да се разпознават взаимно в разнообразието от клетъчни протеини и нуклеинови киселини и спонтанно да се комбинират помежду си, т.е., са способни на самосглобяване.
Самосглобяването се основава на специфично протеин-нуклеиново и протеин-протеиново разпознаване, което може да възникне в резултат на хидрофобни йонни и водородни връзки, както и пространствено съответствие. Разпознаването на протеин-нуклеинова киселина е ограничено до малка област от молекулата на нуклеиновата киселина и се определя от уникални нуклеотидни последователности в некодиращата част на вирусния геном. От това разпознаване на област от геномавирусните капсидни протеини започват процеса на сглобяване на вирусната частица. Прикрепването на останалите протеинови молекули се осъществява поради специфични взаимодействия протеин-протеин или неспецифични взаимодействия протеин-нуклеинова киселина.
Комбинацията на протеин с вирусни нуклеинови киселини в клетката възниква спонтанно като чисто физикохимична реакция на агрегиране, която изисква участието на допълнителни фактори (рН, йонна сила, метални йони, осмоза и др.). След като концентрацията на вирусна РНК и протеин достигне критично ниво; при сложните вируси принципите на самосглобяване се осигуряват от началото до края чрез морфогенеза на вирион.
За да си представим етапа на узряване на потомствените вирусни частици в парамиксовирусите, е необходимо да разберем как молекулата 50S РНК, около 10 хиляди молекули протеини, липиди и захар се сглобяват в заразена клетка и образуват морфологично и биологично пълна частица. Съзряването може да бъде разделено на три етапа: 1) образуване на вътреклетъчни нуклеокапсиди; 2) организация на вирусната мембрана; 3) освобождаване на зряла вирусна частица от клетката с помощта на така нареченото пъпкуване.
Образуване на нуклеокапсид. Бързото включване на 50S РНК в капсида се дължи на относително бързото и обилно натрупване на c. инфектирани клетъчни структурни протеини на нуклеокапсиди. Образуването (сглобяването) на вириони става чрез самосглобяване, което се дължи на "разпознаването" на РНК от протеини. Смята се, че P протеинът е протеинът за разпознаване, тъй като е най-здраво свързан с РНК във вирусните частици. Счита се, че разпознаваемата РНК област е разположена в 5' края на молекулата. Нуклеокапсидите се натрупват в цитоплазмата на заразените клетки и скоростта на образуване на вътреклетъчни нуклеокапсиди е много по-висока от скоростта на образуване на вируса.Образуването на вътреклетъчни нуклеокапсиди е свързано във времето с биосинтезата на 50S РНК.