Тандемни повторения
Фармацевтика, медицина, биология
Тандемни повторения
Тандемните повторения са последователности от повтарящи се ДНК сегменти. В зависимост от размера се делят на три подкласа: сателити, минисателити и микросателити. Името "сателити" идва от спектъра на оптична плътност по време на разделяне на ДНК в градиент на плътност на разтворителя, показващ разлики в относителното средно съдържание на различни нуклеотиди в тандемни повторения в сравнение с останалата част от ДНК.
Размерите на сателитните пачове варират от 100 kbp до над 1 Mpb, с повтаряща се единица обикновено>gt; 100 bp. При хората добре известен пример е алфа ДНК, разположена в центромера на всички хромозоми. Дължината на едно повторение е 171 bp, а целият регион на повторение е 3-5% от дължината на ДНК на всяка хромозома. Други спътници имат къса дължина на повторение. Повечето от сателитите както на хората, така и на други организми са разположени в центромера.
минисателити
Размерът на пълна секция от минисателити варира от 1 kb до 20 kb, с дължина на повторение обикновено 7-100 bp. Един вид минисателит е променливият брой тандемни повторения (VNTR). Дължината му на повторение може да бъде от 9 до 80 базови двойки, а повтарящите се области са разположени в некодиращи области на генома. Броят на повторенията за даден минисателит може да се различава при отделните индивиди, тази характеристика е в основата на метода за генетични пръстови отпечатъци. Друг вид минисателити са теломерите. В човешките генеративни клетки размерът на теломерите е около 15 kb. В стареещите соматични клетки теломерите могат да бъдат значително по-къси. При хора и други бозайници теломерите съдържат GGGTTA тандемна повтаряща се последователност.
микросателити
Микросателити, известни също като къси тандемни повторения (STR), тъй като размерът на повторението е само 1 до 6 bp, а размерът на пълния участък обикновено е до 150 bp. Подобно на минисателитите, броят на повторенията за даден микросателит може да се различава при отделните индивиди. Следователно микросателитите могат да се използват и за генетични пръстови отпечатъци.