СЕКРЕТНИ МАТЕРИАЛИ-2000
МЛАД АГЕНТ НА ФБР Е НАЗНАЧЕН ДА НАБЛЮДАВА ДРУГ АГЕНТ, НО СЕ ИНТЕРЕСУВА ОТ НЕГОВИТЕ РАЗСЛЕДВАНИЯ НА ПАРАНОРМАЛНИ И НЕОБЯСНИМИ ФЕНОМЕНИ.
Специален агент Дейна Скъли, доктор по медицина и инструктор в Академията на ФБР във Вирджиния, е инструктирана да се срещне с шефа Скот Блевинс във Вашингтон. Блевинс възлага на Скъли да разследва и разкрие неодобрения проект Досиета Х, хранилище на мистериозни, неразгадани файлове на ФБР.
Скъли е инструктирана да се свърже с Фос Мълдър. Мълдър се интересува от поредица от убийства в САЩ. Във всички случаи тялото на жертвата оставя две странни червени следи.
Мълдър и Скъли летят до Белфльор, Орегон, за да разследват смъртта на гимназистката Карън Суонсън - по трупа й са открити две странни белези. Агенти ексхумират гроба на Рей Соумс, един от съучениците на Карън. Когато отварят ковчега, вътре се открива хуманоиден скелет. Тялото прилича по структура на орангутан, а рентгеновите снимки показват, че в носната му кухина се намира метален предмет.
В болницата Мълдър и Скъли посещават съучениците на Суенсън и Соумс, Били Майлс и Пеги О'Дел, които са претърпели автомобилна катастрофа. Майлс е в това, което е известно като "кома при събуждане", а О'Дел е прикован към инвалиден стол. Внезапно О'Дел става агресивен и докато се опитва да я покори, Мълдър забелязва два белега по тялото ѝ.
Когато агентите се опитват да открият мястото на смъртта на Карън Суенсън, местен детектив им нарежда да напуснат частната собственост. Те се подчиняват, но докато карат по магистралата, изведнъж са заслепени от ярка светлина в небето. Светлината кара колата да спре. Мълдър поглежда часовника си и разбира, че девет минути са изчезнали безследно.
Партньориобратно в мотела, където Мълдър разкрива на Скъли, че е започнал да се интересува от паранормалното като дете, когато сестра му е била мистериозно отвлечена от стаята му. Мълдър казва, че не е могъл да си спомни подробностите, докато не е бил поставен под хипноза много години по-късно.
Телефонът звъни и анонимен сигнал казва, че Пеги О'Дел е била убита, докато тича по магистралата. Докато разследват, агентите разбират, че резултатите от аутопсията на предишния труп са изчезнали. Те се връщат в хана, за да открият, че стаите им са изгорени, унищожавайки всички доказателства и доказателства.
Агентите се срещат с Тереза Неман, дъщерята на местния следовател, извършил първите аутопсии. Тя казва, че има странни белези и по кожата си и описва как ярка светлина се появила в небето онази вечер, когато се разхождала с Били Майлс и Пеги О'Дел.
Мълдър вярва, че Били Майлс е контролиран от извънземни сили. Той твърди, че Били може да е убил Пеги О'Дел. Агентите се връщат в гората, надявайки се да получат някакви улики. Детектив Майлс се опитва да ги спре, но внезапно той и Мълдър виждат Били да върви с Тереза на ръце към мястото, където са намерени предишните трупове. Тайнствена светлина осветява Били, духа силен вятър. Но миг по-късно всичко свършва и Били не разбира какво се е случило. Следите от кожата му ги няма.
След завръщането си във Вашингтон Скъли изнася своя доклад. За изненада на слушателите металният имплант, изваден от носната кухина на орангутана, е спасен - съхраняван е в джоба на Скъли. Металният предмет е взет от Пушача и отива сам в голям правителствен склад, разположен под Пентагона.