4. Ексцизионен ремонт
Друг вид директен ремонт е открит за едноверижни прекъсвания на ДНК, предизвикани например от йонизиращо лъчение. В този случай ензимътлигазадиректно обединява счупените краища в ДНК молекулата.
4. Ексцизионен ремонт
При този тип ремонт повредените зони се изрязват от ДНК веригата и след това получените празнини се запълват с непокътнат материал.
4.1. Тъмно обезщетение
Тези мутации бяха наречениUvrA(UV-поправка— поправка на UV повреди).UvrAмутантите могат да поправятдимери самос консумация на светлина, т.е. те имат нормална система за фотореактивиране. Поради това беше предложено, че трябва да имадруга система за ремонт, която не изисква светлина. Тази система е нареченатъмноилиизрязване. Тъй като клетките от див типмогатда поправят димери на тъмно, алелът от див тип се наричаUvrA+.
Да приемем, че UV - светлината е причинила образуването на тиминов димер в ДНК (виж Фиг. 8. 10). Разстройството се разпознава отUvrA, B, C - ендонуклеаза; това е ензим, състоящ се от 3 субединици —UvrA,UvrBиUvrC. Този ензим (нуклеаза) прави разрез в увредената верига през 8 нуклеотида към 5' страната на димера и втори разрез през 4–5 нуклеотида от 3' страната. След това изрязаният фрагмент се отстранява, празнината се запълва с ДНК полимераза I и се запечатва с ДНК лигаза.
Променените азотни основи се поправят на тъмно ипо други начини. Клетките съдържат ензимгликозилаза, който може да открие анормалната основа и да я отстрани чрезразкъсване на гликозидната връзкамежду основата и захарта (фиг. 8.12).Тази каталитична активност оставяпразнинав ДНК, където базата е премахната. Тази празнина се наричаАР място(апуриново, ако няма A или G, илиапиримидиново, ако няма C или T).
ЕнзимътАР-ендонуклеазаразпознава наличието на празнина и отрязва гръбнака на ДНК 5' от увредената основа. След това фосфатът в 5' края на отрязаната верига се отстранява сфосфодиестераза.Единичната нуклеотидна празнина се запълва сДНК полимеразаи се запечатва сДНК лигаза.
Към днешна дата са описанимного видове гликозилазни ензими, всеки от които разпознава различни увредени бази - метилирани, дезаминирани и др.