Crysis Warhead, сюжетна линия в играта, кинематографично въведение и кратка предпоставка
Събитията в играта се развиват успоредно със събитията, случили се в Crysis, но в друга част на острова. Главният герой в играта е един от най-известните и централни герои на оригинала - сержант Майкъл Сайкс (сержант Майкъл Сайкс) с прякор Психо (Psycho), който е британски по произход, а не американец.
Директно развитие на сюжета в играта
Играта има 7 игрови нива. Всяко ниво е представено от едно неделимо място. След края на текущото ниво се зарежда следващото ниво. В самите нива няма нива за изтегляне, тъй като данните за играта се зареждат динамично.
Въвеждащо видео и кратка предпоставка
Наричай ме Исмаил (Наричай ме Исмаел)
Събитията в началото на първо ниво започват веднага след края на въвеждащото видео. Крейзи се изкачва от разбития VTOL и се движи през района сам, докато не се натъква на корейски хеликоптер, превозващ неизвестен контейнер. Психото незабавно се свързва с началника на щаба Емерсън и му казва, че контейнерът съдържа ядрена бойна глава и новата му мисия е да я залови. В допълнение, процесът на транспортиране на този товар се ръководи от полковник Лий. Карайки по пътя към брега, Психо се свързва със Шон О'Нийл, пилот на изтребител F-35C, който е негов добър стар приятел. Стигайки до брега, Крейзи става свидетел на масирана бомбардировка на острова и вражеските кораби. След като "изчиства" селото от вражески войници, той става свидетел как двама корейски бойци нокаутират боец с О'Нийл, който впоследствие пада в дълбините на острова.
Напускане на брега
Емерсън инструктира Сайкс да премахне камерата от свален изтребител.О'Нийл. След като изпълнят задачата и се срещнат с оцелелия О'Нийл, те се придвижват по брега до пристанището, в пристанището на което има подводница, готова да вземе контейнера от острова. След като унищожава персонала и сигурността на пристанището под прикритието на О'Нийл на VTOL, Психо се качва в трюма на подводницата, където открива контейнера. Установено е, че товарът изобщо не е ядрена бойна глава, а извънземен механизъм, подобен на този, който няколко пъти атакува отряда Хищници. Неочаквано извънземен робот генерира електромагнитен импулс, който нокаутира Психо. Събуждайки се, Крейзи е заловен от полковник Лий. Полковникът дава заповед да се убие Сайкс, но преди корейският войник да успее да застреля Психо, настъпва неочаквано мигновено разширяване на ледената сфера, в резултат на което корейците незабавно замръзват.